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Technicien(ne) de laboratoire

Entreprise

Raison sociale : ARVALIS

Secteur : RECHERCHE ET DEVELOPPEMENT

Description brève de l'entreprise : ARVALIS est un Institut technique spécialisé en recherche et développement agricole au service des agriculteurs, évalue pour ceux-ci les variétés d’espèces cultivées de grandes cultures pour fournir des conseils sur le choix variétal adapté aux différents milieux et systèmes de cultures.

Poste

Type de contrat : CDD

Lieu : Station Experimentale de Boigneville

Formation souhaitée : BTS/DUT

Date d'embauche souhaitée : Mars 2026

Description des missions : SUJET :
Le phénotypage du compartiment racinaire est complexe et difficile à mettre en oeuvre. Pourtant, de nombreuses questions
scientifiques autour de l’alimentation des cultures en eau et éléments nutritifs pourraient en bénéficier afin de limiter les
contraintes de stress abiotiques. Des méthodes de phénotypage au champ existent telles que la description du chevelu racinaire
à la suite d'un prélèvement à la bêche (« shovelomic), l’analyse des racines dans des carottes de sol (« soil coring ») ou bien un
suivi de la croissance racinaire par imagerie (« minirhizotrons ») mais ces méthodes restent coûteuses et difficiles à mettre en
oeuvre sur un grand nombre de parcelles simultanément. L’objectif de ce projet est d’internaliser une méthode de phénotypage
basée sur l’analyse par PCR quantitative déjà publiée sur blé tendre. Elle consiste à quantifier par PCR l’ADN de l’espèce ciblée
présent dans un échantillon de sol. Il est ensuite possible de relier la concentration en ADN de l’échantillon à la biomasse racinaire
à partir d’une gamme de calibration réalisée en laboratoire. Cette méthode a l’avantage de ne pas nécessiter de lavage de
l’échantillon (contrairement à la shovelomic ou au soil coring) et d’être très sensible et spécifique à l’espèce étudiée. Le projet
aura trois principaux objectifs : 1) internaliser la méthode développée sur blé tendre, 2) l’étendre à d’autres espèces (blé dur,
orge, lin), 3) réaliser une comparaison en conditions agronomiques avec la méthode de référence (« soil coring »). L’internalisation
de cette méthode pourrait permettre de faciliter les travaux portant sur l’évaluation de la plasticité phénotypique du système
racinaire en réponse aux stress ou à l’utilisation de produits biostimulants.
OBJECTIF DU TRAVAIL :
Les principaux objectifs sont :
- Tester les amorces pour des gènes cibles
- Evaluer le nombre de copies de gènes ITS2 dans un panel de variétés françaises
- Etablir des courbes de calibration en PCR quantitative / PCR digitale
- Optimiser les process de laboratoire (extraction d’ADN, amplification PCR)
- Analyser des échantillons issus d’un essai en conditions agronomiques
METHODES ENVISAGEES :
- Broyage d’échantillons de sol
- Extraction d’ADN
- PCR quantitative
- PCR digitale
- Analyse de données