Stage Master 2 (GIS FRUITS) - Microbiote et santé des abricotiers

Entreprise

Raison sociale : INRAE - UMR GAFL

Secteur : AGROALIMENTAIRE – TRANSFORMATION PRODUITS AGRICOLES

Description brève de l'entreprise : L'unité GAFL développe des recherches en génétique des fruits et légumes dont l’objectif est de contribuer à la transition écologique et répondre aux enjeux d’adaptation des systèmes horticoles à la réduction des intrants de synthèse et au changement climatique. Il s’agit de faire de la diversité génétique un levier pertinent et efficace pour accroître la capacité des fruits et légumes et de maintenir une production de qualité face aux stress biotiques et abiotiques dans des systèmes agroécologiques, en synergie avec des leviers techniques complémentaires issus des autres disciplines.

Poste

Type de contrat : Stage

Lieu : CIRAD, Montpellier

Formation souhaitée : Ingénieur/Master

Date d'embauche souhaitée : janvier 2026 – juin 2026

Description des missions : Objectifs généraux du stage / Résultats attendus : Le projet a pour objectifs de (i) décrire la diversité du microbiote (bactéries et champignons) de la phyllosphère des ressources génétiques d’abricotiers, (ii) explorer la part de la génétique de l’hôte dans le déterminisme de la phyllosphère et (iii) caractériser les associations microbiote x génétique abricotier x maladie.

La collection d’abricotiers INRAE du domaine de l’Amarine a été sélectionnée pour mener ce travail, avec la mise en place d’un suivi des maladies, paramètres de croissance, et de phénotypage instrumenté par capteurs de 158 génotypes, en parallèle d’un échantillonnage de la phyllosphère de ces derniers en 2024 et 2025.

Les résultats attendus sont une meilleure évaluation de la dynamique d’association entre génétique de l’abricotier, incidence des maladies et structure du microbiote de la phyllosphère et de la contribution entre la génétique de l’hôte et son microbiote dans l’état sanitaire des abricotiers.

Compétences demandées :

• Scientifiques

Autres compétences demandées : Ecologie microbienne, Biologie Moléculaire et Biostatistiques

Informations complémentaires : Le GAFL, à travers INRAE, fait partie du GIS FRUITS, Groupement d'Intérêt Scientifique Fruits qui regroupe 22 partenaires de la filière fruitière française, impliqués dans la recherche, le développement, la formation et l'organisation professionnelle, afin de mettre en œuvre dans la durée, une stratégie commune, allant de la recherche jusqu’au transfert des innovations vers les acteurs économiques. Le GIS Fruits souhaite soutenir des stages étudiants de 6 mois, niveau Master 2 sur le thème des fruits et offre pour cela de financer des bourses de stages réalisés dans des labos INRAE, comme la présente offre de stage.

Adhérent VEGEPOLYS VALLEY : Oui

Contact(s) pour l'annonce : Bénédicte Quilot, Directrice de recherche INRAE

Téléphone pour l'annonce : 04.32.72.27.63