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Journée Sciences et Partenariats - Outils d'analyse des génomes des plantes

9h00  - 17h00
14/06/2022
  • Autres régions de France
Payant
  • Mode de production agroécologique
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Le Carnot Plant2pro rassemble des compétences de recherche et d’innovation portant sur les outils d’analyse des génomes. Ces outils sont devenus indispensables aux processus d’accélération des stratégies d’amélioration des plantes mises en œuvre par les entreprises du secteur de l’obtention. Ils atteignent aujourd’hui des TRL élevés (TRL 6) et sont susceptibles d’intéresser des partenaires socio-économiques pour leurs projets de recherche. Cette journée est organisée afin de présenter les principaux résultats de ces techniques à date, les outils, ainsi que les plateformes de ces unités de recherche.

La journée s'organisera en 2 temps : des présentations le matin, et des échanges BtoB l'après-midi.

Découvrez le programme de la journée :

09h00 : Accueil

09h15 - 09h30 : INTRODUCTION : présentation de Plant2pro, objectifs de la journée

09h30 - 10h15 : Session 1 :  Génotyper, Sequencer et Détecter des variants structuraux :

  • Sonia Vautrin, CNRGV : Capture de grandes régions génomiques associées à des traits majeurs. (Projet soutenu par Plant2Pro)
  • Patricia Faivre-Rampant, EPGV : Génotypage de SNP cibles par séquençage
  • Stéphane Nicolas, GQE : Développement d'une puce de génotypage haut débit des Insertions/Délétions chez le maïs: Application aux études d'associations pangénomiques.
     

10h15-11h00 : session 2 : Annoter et Interpréter des génomes :

  • Jérôme Gouzy, LIPME : Eugene, logiciel pour l'annotation automatique des gènes de génomes de plantes
  • Frédéric Choulet, GDEC : Triannot, MAGATT et CLARITE : outils d’annotation des gènes et éléments transposables du génome du blé
  • Hadi Quesneville, URGI : REPET, un outil pour l'identification des éléments transposables et leur impact sur le fonctionnement des génomes
     

11h00 - 11h30 : pause café

11h30 - 13h00 : Session 3 : Explorer la diversité allélique, Comparer les génomes

  • François Parcy, PCV : Comment exploiter les réseaux transcriptionnels pour poursuivre la domestication des plantes
  • Jerome Gouzy, LIPME : ATLAS, Exploration du catalogue d'allèles des espèces cultivées (Projet soutenu par Plant2Pro)
  • Jerome Salse, GDEC : Synteny Viewer, outil de recherche translationnelle pour la sélection (Projet soutenu par Plant2Pro)
  • Julien Rozière IPS2/IJPB : PLMView : un outil de recherche pour explorer la diversité des motifs régulateurs à proximité des gènes (Projet soutenu par Plant2Pro)
     

13h00 - 14h30 : Dejeuner

14h30 - 15h00 : Session 4 : Présentation des plateformes :

  • Charles Poncet GENTYANE, GDEC et EPGV : plateforme de génotypage et séquençage à haut débit
  • Arnaud Bellec, CNRGV : Analyser la structure des génomes végétaux grâce aux cartes optiques
  • Etienne Delannoy, IPS2 : POPS, plateforme transcriptomique
  • Marion Dalmais et Fabien Marcel, IPS2 : EPITRANS, plateforme Épigénomique & Biologie translationnelle
     

15h00 - 16h00 : RDV B to B (3 creneaux de 20 min)

16h00 - 16h30 : Pause

16h30 - 17h30 : RDV B to B (3 creneaux de 20 min)



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Infos pratiques

Lieu : Espace Formeret Larochefoucauld, 11 Rue Catherine de La Rochefoucauld, 75009 Paris

Tarif : 100 €

VEGEPOLYS VALLEY partenaire de l'événement propose un tarif préférentiel à ses adhérents, contactez Ludivine Marion.